Очистка перколяцией, или так называемое, подпочвенное орошение является одной из самых старых применяемых человеком систем. Работает она на основе равномерного разбрызгивания сверху вниз сточных вод на так называемую «перколяционную основу», образованную из нескольких слоев осушающего материала (щебня, пластмассовых материалов и т.д.), позволяющего воспроизвести ту же микробиологическую среду, что встречается в природе. В природном грунте, даже очень пористом и хорошо осушаемом, количество воздуха, необходимого для массы бактерий, перерабатывающих и преобразовывающих органические вещества, относительно мало.

Напротив, перколяционные системы выполнены так, чтобы посредством рационального и обильного доступа воздуха способствовать увеличению развития аэробных микроорганизмов, способных провести вышеуказанную переработку в гораздо меньшем пространстве и за меньшие отрезки времени. На начальном этапе, который может длиться от нескольких недель до нескольких месяцев, очистка может не оказаться максимально эффективной, поскольку на фильтрующем материале биологическая пленка еще не образовалась.

Существуют дополнительные решения и системы, позволяющие достичь оптимальной степени очистки сточных вод, поступающих из населенных мест, для которых характерны очень неравномерные водные нагрузки, как например, рестораны, второе жилье, агротуристические хозяйства и т.д.