Очищення перколяцией, або так зване, подпочвенное зрошення є однією з найстаріших застосовуваних людиною систем. Працює вона на основі рівномірного розбризкування зверху вниз стічних вод на так звану «перколяционную основу», утворену з декількох шарів осушающего матеріалу (щебеню, пластмасових матеріалів тощо), що дозволяє відтворити ту ж мікробіологічне середовище, що зустрічається в природі. У природному грунті, навіть дуже пористому і добре осушуваному, кількість повітря, необхідного для маси бактерій, що переробляють і преобразовывающих органічні речовини, відносно мало.

Навпаки, перколяційні системи виконані так, щоб за допомогою раціонального і рясного доступу повітря сприяти збільшенню розвитку аеробних мікроорганізмів, здатних провести вищевказану переробку в набагато меншому просторі і за менші відрізки часу. На початковому етапі, який може тривати від декількох тижнів до декількох місяців, очищення може не виявитися максимально ефективною, оскільки на фільтруючому матеріалі біологічна плівка ще не утворилася.

Існують додаткові рішення і системи, що дозволяють досягти оптимального ступеня очищення стічних вод, що поступають з населених місць, для яких характерні дуже нерівномірні водні навантаження, як, наприклад, ресторани, друге житло, агротуристичні господарства і т. д.